Biopython 安装

本节介绍如何在你的机器上安装 Biopython。它非常容易安装，不会超过五分钟。

步骤 1 ： 验证 Python 安装

Biopython 旨在与 Python 2.5 或更高版本一起使用。因此，必须先安装 python。在命令提示符下运行以下命令：

> python --version

定义如下：

如果安装正确，它会显示 python 的版本。否则，请下载最新版本的 python，安装它，然后再次运行该命令。

步骤 2 ： 使用 pip 安装 Biopython

在所有平台上使用 pip 从命令行安装 Biopython 很容易。输入以下命令：

> pip install biopython

屏幕上会出现以下响应：

更新旧版本的 Biopython：

> pip install biopython –-upgrade

屏幕上会出现以下响应：

执行此命令后，旧版本的 Biopython 和 NumPy(Biopython 依赖它)将在安装最新版本之前被删除。

步骤 3 ：验证Biopython安装

现在，你已经在你的机器上成功安装了 Biopython。要验证 Biopython 是否已正确安装，请在你的 python 控制台上键入以下命令：

它显示了 Biopython 的版本。

另一种方式：使用源码安装Biopython

要使用源代码安装 Biopython，请按照以下说明进行操作：

从以下链接下载最近发布的 Biopython： https://biopython.org/wiki/下载

截至目前，最新版本为 biopython-1.72 .

下载文件并解压压缩包，进入源代码文件夹，输入以下命令：

> python setup.py build

这将从下面给出的源代码构建 Biopython：

现在，使用以下命令测试代码：

> python setup.py test

最后，使用以下命令安装：

> python setup.py install